Formado en una corriente estética de corte nacionalista, en la que los símbolos y figuras pretendían hablar sobre la esencia de la identidad mexicana, Eppens es creador de algunos murales como los del Hospital Infantil de México, el del edificio central del PRI y el del Teatro Morelos de la ciudad de Aguascalientes.[cita requerida]
En 1968, el presidente Gustavo Díaz Ordaz ordenó un pequeño cambio al Escudo Nacional, de modo que el águila se mostrara más agresiva. Este diseño del pintor Francisco Eppens Helguera se usa de manera oficial en banderas, sellos, monedas y documentos oficiales.[cita requerida]
“Viajando al Universo de EPPENS” UNA MIRADA NACIONALISTA. Exposición del Maestro Francisco Eppens en la Sala de Exposiciones de Centro Médico Nacional Siglo XXI IMSS, del 24 de febrero al 29 de mayo de 2011 (5977 Visitantes). Esta fue la exposición hasta la fecha más grande de la obra de este autor. Contenía proyectos murales y escultóricos, la reproducción del mural de la Facultad de Medicina en C.U., la colección de Timbres Fiscales y Postales, propiedad de la Secretaría de Hacienda, obra de caballete, los originales del Escudo Nacional, y más. Su hija y única familiar directa, Gabriela Eppens Lascurain, fue la promotora de esta exposición, junto con Diana Martha Calleja, reconocida promotora cultural, y Antonio Cortés, museógrafo de importantes y diversas exposiciones. Esta unión hizo posible que se llevará a cabo este magno homenaje irrepetible en el IMSS, ya que su hija no ha logrado concluir su ideal de crear el museo Francisco Eppens Helguera.[cita requerida]
El 1° de febrero de 2013 con una exposición de estampillas postales, 24 fotografías y el Sorteo Superior N.º 2343, cuyos billetes difundieron la obra “Vida, Muerte, Mestizaje y los Cuatro Elementos” Mural de la Facultad de Medicina de C.U.[cita requerida]
La Facultad de Medicina de la UNAM organiza el Congreso Internacional Eppens Interprofesionalismo 2023.