Aunque algunos historiadores atribuyen a la diócesis orígenes anteriores, probablemente fue erigida en el siglo X, época de la que se encuentran ciertas evidencias.
En 986 Zamora fue conquistada por los árabes y suprimido el obispado.
Fue restablecida en 1121, tras la Reconquista cristiana. En el momento del restablecimiento de la sede la diócesis fue objeto de una controversia entre los arzobispos de Toledo y los de Braga, ya que ambos reclamaban a Zamora como sufragánea. El papaCalixto II decidió entonces eximir a la diócesis de la jurisdicción metropolitana, pero ya hacia mediados de siglo el papa Eugenio III reconoció las pretensiones de los arzobispos de Braga, confirmadas también por sus sucesores.
En 1151 se inició la construcción de la catedral románica, rematada por una cúpula bizantina original y consagrada en 1174.
En el primer cuarto del siglo XIII, el papa Inocencio III asignó la diócesis como sufragánea de la archidiócesis de Santiago de Compostela, ya que en la antigüedad había sido sufragánea de Mérida, de la que Santiago de Compostela derivaba el rango metropolitano.
En 1797 se estableció el seminario diocesano, dedicado a san Atilano. El seminario derivaba de un colegio fundado en 1712 y confiado a los padres jesuitas, que habían sido expulsados en 1767.
Tras el Concordato de 1851, el 4 de julio de 1857 la diócesis pasó a formar parte de la nueva provincia eclesiástica de la archidiócesis de Valladolid.
El 17 de octubre de 1954, en virtud del decreto Quum sollemnibus de la Congregación Consistorial, se revisaron los límites de la diócesis para hacerlos coincidir con los de la provincia civil, en aplicación del concordato entre la Santa Sede y el gobierno español de 1953. La diócesis de Zamora cedió 14 parroquias a la archidiócesis de Valladolid y 5 a la diócesis de Salamanca; pero se amplió con 39 parroquias en la provincia de Zamora que pertenecían a las sedes de Salamanca, Astorga, León y Oviedo.[2]
Estadísticas
Según el Anuario Pontificio 2023 la diócesis tenía a fines de 2022 un total de 142 475 fieles bautizados.
Según cifras oficiales, en el curso 2017-2018 se formaron 5 seminaristas en el Seminario Mayor.[4]
En la actualidad existen siete casas y siete órdenes de religiosos. De religiosas de vida contemplativa hay diez órdenes y congregaciones con 17 casas; mientras que de religiosas de vida activa hay trece órdenes o congregaciones, con 28 casas. En cuanto a los institutos seculares, hay cinco institutos, con cinco casas y 47 miembros. Existen 35 movimientos y asociaciones de apostolado seglar, 28 de adultos y siete de jóvenes.
GÓMEZ RÍOS, MANUEL. "Los obispos de Zamora (1600-1900), en los documentos del Archivo Secreto Vaticano". Instituto de Estudios Zamoranos Florián de Ocampo. Diputación de Zamora. Caja España. 2000.
LERA MAÍLLO, JOSÉ CARLOS DE. "Catálogo de los documentos medievales de la Catedral de Zamora". Instituto de Estudios Zamoranos Florián de Ocampo. Diputación de Zamora. 1999.
MUÑOZ MIÑAMBRES, JOSÉ. "Historia Civil y eclesiástica de Zamora (siglo XIX)". 1996.
BÉCARES BOTAS, VICENTE. "Las bibliotecas monásticas y la desamortización en la provincia de Zamora". Editorial Semuret. 1999.
BÉCARES BOTAS, VICENTE. "Los patronos de Zamora San Ildefonso y San Atilano". 1990.
ASUNCIÓN ALMUIÑA, TRÁNSITO FERREAS Y PILAR HERRERO. "Catálogo de la Biblioteca del Seminario Conciliar de Zamora (fondo antiguo)". Instituto de Estudios Zamoranos Florián de Ocampo. Diputación de Zamora. 1992.
JOSÉ CARLOS DE LERA MAÍLLO Y PETER LINEHAN. "Las postrimerías de un obispo alfonsino: Don Suero Pérez, el de Zamora". Editorial Semuret. 2003.