Deir es-Sultan es uno de los lugares santos de la zona que se disputan varias confesiones cristianas.[3] El monasterio está situado en el tejado de la capilla de Santa Elena, una capilla subterránea que forma parte del complejo de la iglesia del Santo Sepulcro, y tiene una entrada que conduce al parvis (el patio de la Iglesia). El monasterio ocupa una superficie de 1800 metros2 .[4]
En 1654, los monjes etíopes fueron acogidos temporalmente por los coptos como huéspedes en algunas salas del monasterio, ya que sus iglesias de Jerusalén fueron adquiridas por las Iglesias griega y armenia debido a la imposibilidad de pagar los impuestos.[5] En el siglo XIX, el sultán Abdul Hamid II concedió a los monjes etíopes el derecho a instalar una gran carpa en el tejado del Santo Sepulcro para celebrar la Pascua.[6] Durante la Vigilia pascual el 25 de abril de 1970, el gobierno israelí envió fuerzas militares para cambiar las cerraduras del monasterio y permitir a los monjes etíopes hacerse con el control del monasterio. El obispo copto presentó un recurso ante la Corte Suprema de Israel, que aprobó por unanimidad la devolución del monasterio a la Iglesia copta el 16 de marzo de 1971, aunque el gobierno se negó a aplicar la sentencia de este tribunal.[5]
En octubre de 2018, un sacerdote copto fue detenido a raíz de las protestas contra las obras de restauración del monasterio sin el consentimiento de la Iglesia copta.[7] En abril de 2021, se produjeron "ligeros enfrentamientos" entre monjes egipcios y etíopes, ya que estos últimos instalaron una tienda e izaron la bandera etíope en el interior del monasterio.[8] El mismo incidente se repitió un año después, el 18 de abril de 2022,[9] esto provocó que los monjes coptos pintasen la bandera de Egipto en la puerta principal de acceso al monasterio, adyacente a la entrada del archidiócesis copta ortodoxa de Jerusalén y Cercano Oriente.[10]