La Copa Korać 1998-99 fue la vigésimo octava edición de la Copa Korać, competición creada por la FIBA para equipos europeos que no disputaran ni la Copa de Europa ni la Recopa. Participaron 93 equipos, ocho más que en la edición anterior. En la final, se enfrentaron dos equipos españoles siendo el campeón el F. C. Barcelona, que lograba su segundo título, derrotando en la final al Adecco Estudiantes.
Primera ronda
Segunda ronda
Tercera ronda
Octavos de final
Cuartos de final
Semifinales
Final
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