AFA Rímac fue fundado el 28 de septiembre de 1985 en el distrito del Rímac. En el año 2005 participó y ganó la División de Ascenso de la Asociación Peruana de Futsal, encargada de regular el fútbol de salón de acuerdo a las reglas de la AMF. En 2008 cambió al futsal FIFA al inscribirse en la División Superior de la FPF; ese mismo año logró ascender a la División de Honor categoría en la que se ha mantenido desde entonces.
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En el año 2011 el club alcanzó la final de la División de Honor luego de vencer en las semifinales a TigreGraph en la tanda de penales por 6 - 5 luego de que el partido terminara empatado 7 - 7. En la final jugada frente a Deportivo Panta, fue derrotado por 6 - 3. El subcampeonato de este año sigue siendo el máximo logro deportivo del club.
Posteriormente el club alcanzaría un tercer lugar en el año 2012,[3] 2013, 2016, 2018 y un cuarto lugar en el 2014. Además ganó el Torneo Clausura de 2014 y 2017.[4]
A pesar del subcampeonato obtenido en 2011, el club no ha jugado nunca la Copa Libertadores de fútbol sala debido a que la edición de 2012 no se llevó a cabo.
