Segantini naskiĝis en tiam aŭstra regiono ĉe Garda-Lago. Post frua morto de siaj gepatroj li vivis en orfejo kaj fariĝis ŝuisto. En 1874 li ekstudis en Akademio Belarta de Brera en Milano. La pentris interalie la Alpojn laŭ nov-impresionisma stilo.
En 1880 li edziĝis al Bice BUGATTI. Ŝi naskis kvar idojn. De 1880 ĝis 1886 la familio loĝis en Brianco, regiono kun monteto kaj lagoj inter Lecco kaj Milano. Post li transloĝiĝis al Svislando. Ĝis 1894 li loĝis en Savognin, poste en Maloja. Li mortis pro peritoneito.
Granda kolekto de liaj verkoj troviĝas en Segantini-muzeo en Sankta Maŭrico.
