Το Κύπελλο Ερασιτεχνικών Ομάδων Ε.Π.Σ. 2015–16 είναι η 43η διοργάνωση του θεσμού του Κυπέλλου Ερασιτεχνών. Την πρώτη φάση αποτελούν οι διοργανώσεις των κυπέλλων των κατά τόπους Ενώσεων Ποδοσφαιρικών Σωματείων. Οι κυπελλούχες ομάδες των τοπικών ενώσεων αγωνίζονται στη δεύτερη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών, με διοργανώτρια αρχή την Ελληνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία. Σε περίπτωση κατάκτησης του τροπαίου από ομάδα που αγωνίζεται σε τοπικό πρωτάθλημα, η συγκεκριμένη ομάδα κερδίζει αυτόματα την άνοδο στη Γ΄ Εθνική ερασιτεχνική κατηγορία.[1] Στις 24 Φεβρουαρίου του 2016, έγινε η κλήρωση της δεύτερης φάσης.[2]
Ομάδες
Οι ενώσεις ποδοσφαιρικών σωματείων χωρίζονται σε εννέα ομίλους με βάση τη γεωγραφική τους θέση. Κάθε ομάδα μετέχει στον όμιλο στον οποίο βρίσκεται η ένωση στην οποία ανήκει.
Πηγή:ΕΠΟ Μέθοδος πρόκρισης: νοκ-άουτ αναμετρήσεις Σημείωση: Δεν έλαβε μέρος η κυπελλούχος ομάδα των Γρεβενών, Πυρσός και αντικαταστάθηκε από Α.Ε. Ποντίων Βατολάκκου
Στην προημιτελική φάση κληρώθηκαν οι νικήτριες του 1ου, 2ου, 3ου, 4ου, 7ου, 8ου και 9ου ομίλου, με τη νικήτρια του αγώνα της ενδιάμεσης φάσης να εισέρχεται εν συνεχεία. Οι αγώνες ορίστηκαν για τις 13 Απριλίου του 2016.