Το Κύπελλο Ελλάδας γυναικών για την περίοδο 2012-13 είναι το τέταρτο στην ιστορία της διοργάνωσης και μόλις το πρώτο μετά από έντεκα χρόνια αδράνειας. Μετέχουν οι 20 ομάδες της Α' Εθνικής και της Β' Εθνικής (από 10 ομάδες) γυναικών.
Σύστημα διεξαγωγής
Το κύπελλο θα διεξαχθεί σε πέντε φάσεις. Σε όλες τις φάσεις θα διεξαχθούν μονοί αγώνες.
Στην πρώτη φάση οι δέκα ομάδες της Β' Εθνικής θα αντιμετωπίσουν στην έδρα τους τις δέκα ομάδες της Α' Εθνικής. Οι δέκα νικήτριες θα προκριθούν στη Β' φάση.
Μετά από κλήρωση, έξι νικήτριες της Α' Φάσης θα προκριθούν χωρίς αγώνα στους προημιτελικούς, ενώ οι άλλες τέσσερις θα σχηματίσουν δύο ζευγάρια. Οι δύο νικήτριες θα προκριθούν στους προημιτελικούς.
Οι δύο νικήτριες της Β' φάσης καθώς και οι έξι ομάδες που προκρίθηκαν χωρίς αγώνα, θα σχηματίσουν τέσσερα ζευγάρια. Οι τέσσερις νικήτριες θα προκριθούν στην τελική φάση.
Η τελική φάση που περιλαμβάνει τους ημιτελικούς και τον τελικό θα διεξαχθεί σε έναν τόπο, σε σύστημα final 4. Οι νικήτριες των ημιτελικών θα αγωνιστούν δύο μέρες μετά στον τελικό.
Α' φάση
Στην Α' φάση οι δέκα ομάδες της Α' Εθνικής αντιμετώπισαν εκτός έδρας δέκα ομάδες της Β' Εθνικής. Οι αγώνες έγιναν στις 16 Δεκεμβρίου2012.