Karkowski arbeitete mit akustischen und elektro-akustischen Instrumenten. So hat er Stücke für große Orchester geschrieben wie auch eine Oper und unterschiedliche Kammermusikstücke, die von diversen Ensembles in Schweden, Polen und Deutschland aufgeführt wurden. Mit Edwin van der Heide und Atau Tanaka war er Gründungsmitglied des elektroakustischen Musik-Performance-Trios Sensorband. Auf den meisten seiner etwa 60 Alben arbeitete Karkowski mit Dokumentationen und Bearbeitungen bis hin zu einfachen Dekorationen von Field Recordings. Bei der Bearbeitung fallen unterschiedliche Störsignale (vor allem Distortions) besonders auf.
Mit der Formation Sensorband erfand und verwirklichte Karkowski ein monumentales, 120 m² großes Musikinstrument namens Soundnet.[2] Für Mutation (1999) erlangte er Aufnahmeerlaubnis in einem Tempel in Kyōto.
Er starb im Dezember 2013 an Bauchspeicheldrüsenkrebs.[3]
