Yann Millon war 1998 und 1999 Weltmeister sowie 1997 und 2000 Vizeweltmeister der Internationalen Triathlon Union im Duathlon über die Kurzdistanz (10 km Laufen, 40 km Radfahren und 5 km Laufen).
Mit der französischen Nationalmannschaft war er 1996 und 1997 Vizeeuropameister im Crosslauf und wurde 2000 Europameister.
Darüber hinaus gewann er mit seiner Staffel die französischen Meisterschaften über 4 × 1500 m (1990) und wurde mehrfach mit seinem Team französischer Meister im Crosslauf (1993, 1994).