Am 14. März 1995 wurde Dupré Bischof von Springfield in Massachusetts. Dupré war Nachfolger des Bischofs John Aloysius Marshall.
Am 11. Februar 2004 legte Dupré aus gesundheitlichen Gründen sein Amt als Bischof nieder. Seine Amtsniederlegung erfolgte, nachdem die regionale Zeitung The Springfield Republican Dupré mit zwei Missbrauchsfällen von Messdienern aus seiner früheren Zeit als einfacher Priester konfrontiert hatte. Im September 2004 wurde Dupré von einem Gericht in Hampden County wegen sexuellen Missbrauchs von Kindern strafrechtlich angeklagt.[2] Da die Straftaten mittlerweile verjährt waren, wurde das Strafverfahren eingestellt.[3] Nach dem Ende des Strafverfahrens ließ sich Dupré im psychiatrischen Krankenhaus in katholischer Trägerschaft St. Luke Institut in Silver Spring, Maryland, behandeln. Zuletzt lebte Dupré in St. Luke.