Der Skilanglauf-Alpencup 2005/06 war eine von der FIS organisierte Wettkampfserie, die zum Unterbau des Skilanglauf-Weltcups 2005/06 gehörte. Er begann am 10. Dezember 2005 in Toblach und endete am 26. Februar 2006 in Candanchú. Die Gesamtwertung der Männer gewann Loris Frasnelli und bei den Frauen Katrin Zeller.