Rodrigo stammte aus einer Architektenfamilie und war der Sohn von Juan Gil de Hontañón sowie Bruder von Juan Gil de Hontañón dem Jüngeren.
Nach dem Tod seines Vaters wurde er dessen Nachfolger als Baumeister an der Kathedrale von Segovia (1526). Auch mit dem Baufortschritt der Kathedrale von Astorga wird er in Verbindung gebracht.
Er war einer der angesehensten und meist beschäftigten Architekten Spanien.
Werke
St. Jakob (Kirche), Medina de Rioseco (1533- )
Fassade der Iglesia de Santiago Apóstol in Cigales (um 1535)
