Nach sieben Jahren beim belgischen RadsportteamLotto wechselte Verbrugghe 2005 für ein Jahr zur Mannschaft Quick Step. Ab 2006 fuhr er für die Équipe Cofidis. Ende der Saison 2008 beendete er seine Karriere.
Nach seiner Karriere als Aktiver wurde Verbrugghe 2012 Sportlicher Leiter zunächst beim BMC Racing Team.