Von 1876 bis 1884 war er Kardinalvikar des Bistums Rom. 1878 war er Teilnehmer des Konklaves zur Wahl Papst Leo XIII. 1884 wurde Monaco La Valletta von diesem zum Kardinalbischof von Albano erhoben. Von 1884 bis 1889 war er Sekretär der Kongregation der römischen und allgemeinen Inquisition (Congregatio Romanae et universalis Inquisitionis, auch Sanctum Officium genannt) und wurde 1889 zum Kardinaldekan ernannt, womit die Ernennung zum Kardinalbischof von Ostia verbunden war. Mit dieser Ernennung übernahm er dann bis zu seinem Tod im Jahre 1896 die Leitung der Kongregation für die Zeremonien. Zugleich war der Kardinal seit 1884 bis zu seinem Tode Kardinalgroßpönitentiar.
Raffaele Monaco La Valletta war Ehren- und Devotions-Großkreuz-Bailli des Souveränen Malteserordens und von 1894 bis 1896 Großprior des Großpriorates von Rom des Malteserordens.[1]