Die Prva Liga RS 2006/07 war die insgesamt zwölfte Saison der Republika Srpska und die fünfte als nur noch zweithöchste Spielklasse Bosnien-Herzegowinas im Fußball der Männer. Sie begann am 12. August 2006 und endete am 10. Juni 2007.
16 Mannschaften spielten an insgesamt 30 Spieltagen aufgeteilt in einer Hin- und einer Rückrunde jeweils zwei Mal gegeneinander. Der Meister stieg in die Premijer Liga 2007/08 auf, während die letzten vier Teams in die drittklassige Druga Liga abstiegen.
Drina Zvornik, Glasinac Sokolac und Borac Šamac wurden jeweils sechs Punkte abgezogen. Borac erhielt zudem eine Platzsperre für ein Spiel, da das Team im Spiel gegen Kozara Gradiška nach 70 Minuten beim Stand von 1:3 das Spielfeld verließen. Die Begegnung wurde anschließend mit 0:3 gewertet.
Das Spiel Borac Šamac gegen FK Laktaši wurde nach 70 Minuten beim Stand von 1:3 abgebrochen und mit 0:3 gewertet.
2
Das Spiel FK Sloga Doboj gegen Borac Šamac wurde in der 38 Minute beim Stand von 0:1 abgebrochen und mit 0:3 gewertet.
3
Das Spiel Omladinac Banja Luka gegen Sloga Doboj wurde nach 39 Minuten beim Stand von 1:2 wegen tätlichen Angriffs auf den Schiedsrichter abgebrochen und mit 0:3 gewertet.