Die Prva Crnogorska Liga 2012/13 war die siebte Spielzeit der höchsten montenegrinischen Fußballliga. Die Saison begann am 11. August 2012 und endete am 1. Juni 2013 mit dem 33. und letzten Spieltag.
Die zwölf Mannschaften traten in je drei Runden gegeneinander an, sodass 33 Spieltage zu absolvieren waren. Die Teams, die nach 22 Spielen die ersten sechs Plätze belegten, hatten zusätzlich sechs Heimspiele, die Teams auf den unteren sechs Plätzen noch fünf Heimspiele. Der Tabellenletzte stieg in die Druga Crnogorska Liga ab. Die Teams auf den Plätzen zehn und elf spielten in der Relegation um den Klassenerhalt.
Die im Vorjahr zehnt- und elfplatzierten Vereine FK Dečić Tuzi und FK Berane unterlagen in der Relegation gegen die zweit- und drittplatzierten Teams FK Jedinstvo Bijelo Polje und FK Mornar Bar der zweiten Liga. Damit gab es in dieser Spielzeit drei Aufsteiger.
Platzierungskriterien: 1. Punkte – 2. Tordifferenz – 3. geschossene Tore
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Der Pokalsieger FK Budućnost Podgorica sowie der Viertplatzierte FK Grbalj Radanovići erhielten von der UEFA keine Lizenz für die Teilnahme an der Europa League. Somit rückten entsprechend Mannschaften nach.
Die Begegnung zwischen dem FK Mogren Budva und dem FK Mladost Podgorica am 1. Spieltag wurde mit 0:3 strafverifiziert da Mogren nicht antrat.
Relegationsspiele
Die nach Ablauf der regulären Saison zehnt- und elftplatzierten Teams spielten in einem Hin- und Rückspiel gegen die dritt- bzw. zweitplatzierten Teams der zweiten Liga. Beide Erstligateams schafften den Klassenerhalt.
