Die Wüste liegt etwa 100 km nordwestlich von Oodnadatta und etwa 250 km nordöstlich von Coober Pedy in South Australia. Die Pedirka-Wüste ist ein Dünenfeld im Nordwesten von Oodnadatta, das sich weiter bis zum Witjira-Nationalpark erstreckt. Es wird im Norden durch den Hamilton Creek begrenzt. Nördlich dieses Creeks liegt eine steinige Ebene.[2]
The Pedirka-Wüste wird durch den Oodnadatta Track erschlossen, der Dalhousie Springs und den Witjira-Nationalpark verbindet. In der Wüste befinden sich mehrere Trinkwasserquellen, die für die Viehwirtschaft gebohrt wurden.[2]