Palemonas begann sich 1862 nach dem Bau der Eisenbahnlinie Vilnius-Kaunas am rechten Ufer des Nemunas zu entwickeln. Um 1900 befand sich in diesem Gebiet ein Gutshof von Apnarai. In Palemonas eröffnete die SS ein KZ-Außenlager (Männerlager) von Konzentrationslager Kauen etwa Ende November bis Dezember 1943. Die Räumung erfolgte am 7. Juli 1944 per Schiff nach Deutschland. 1976 wurde die Sekundarschule Palemonas eingerichtet, jetzt das Gymnasium von Palemonas. 2021 eröffnete man das Containerterminal von Kaunas im Umschlagbahnhof Palemonas.
Palemonas. Lietuviškoji tarybinė enciklopedija, VIII t. Vilnius: Mokslo ir enciklopedijų leidybos institutas, 1981. T.VIII: Moreasas-Pinturikjas, 421 psl.