In Nsukka entstand 1955 die erste von Einheimischen gegründete und geführte Universität Nigerias, die University of Nigeria, gegründet von Nnamdi Azikiwe, dem ersten Staatspräsidenten des Landes.
Nsukka lag im Gebiet des Staates Biafra, der 1967–1970 bestand. Im Juli 1967 war die Stadt eine der ersten, die im biafranischen Unabhängigkeitskrieg gegen den nigerianischen Zentralstaat von den nigerianischen Truppen zurückerobert wurden.