Die Gemeinde Mouscardès liegt in der Landschaft Chalosse, etwa 17 Kilometer südöstlich von Dax. Umgeben wird Mouscardès von den Nachbargemeinden Estibeaux im Westen und Norden, Pomarez im Norden und Nordosten, Tilh im Osten, Ossages im Süden sowie Habas im Südwesten. Im Süden begrenzt der Fluss Grand Arrigan das Gemeindegebiet.