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Die erste urkundliche Erwähnung von Marfino stammt aus dem Jahr 1585. Seit 1698 war das Haus Galitzin Besitzer des Ortes. In den Jahren 1701–1707 wurde hier eine Märiä Geburt geweihte Kirche errichtet. 1728 kaufte Semjon Andrejewitsch Saltykow den Ort Marfino. Unter der Leitung seines Sohnes Pjotr Semjonowitsch Saltykow wurde in den 1760er Jahren ein zweistöckiges Barockgebäude errichtet. Pjotr Saltykow starb hier am 6. Januar 1773.
Im Jahr 1770 wurde eine kleine Kirche für Petrus und Paulus in Marfino errichtet. Von 1827 bis 1829 wurde der Architekt Michail Bykowsky durch die neue Besitzerin des Ortes, Sofja Wladimirowna Orlowa, mit dem Wiederaufbau des Herrenhauses im Stil russischer Pseudogotik beauftragt. Nach der Oktoberrevolution wurde Marfino verstaatlicht. Die Kunstwerke und die Bibliothek wurden überwiegend dem Staatlichen Historischen Museum übergeben.
