Der Ort liegt auf der Insel Hinnøya südlich der Kernstadt am westlichen Ufer der Kilbotnbucht (Kilbotnbuka), einer Ausbuchtung des Vågsfjords in dessen südwestlichem Teil, und nördlich der Einfahrt vom Vågsfjord in den Tjeldsund, der zum Ofotfjord und damit nach Narvik führt.
Kilbotn wird im Westen von der Reichsstraße 83 (Riksvei 83, Rv83) umfahren, die von der 1967 fertiggestellten Tjeldsundbrücke (1007 m lang, lichte Höhe 41 m über dem Wasserspiegel)[1] und damit von der Europastraße 10 nach Harstad verläuft.
