Joseph Andreas Lindauer empfing am 15. August 1807 in Prag die Priesterweihe und wirkte anschließend als Kaplan in mehreren Pfarreien im Pilsener Gebiet. Später wurde er Dekan in Přeštice und danach Archidekan in Pilsen. Ab 1835 gehörte er dem Metropolitankapitel zu St. Veit in Prag an.
Nach dem Tod des Budweiser Bischofs Ernest Konstantin Růžička ernannte Ferdinand I., dem das Nominationsrecht in seiner Eigenschaft als Kaiser von Österreich zustand, am 22. September 1845 Joseph Andres Lindauer zu dessen Nachfolger.
