Ab 1993 war José Carlos Brandão Cabral Pfarrer der PfarreiMenino Jesus in Limeira. Daneben wirkte er von 1999 bis 2004 als Kaplan der Casa de Misericórdia und von 1995 bis 2004 als Spiritual am Priesterseminar São João Maria Vianney. Von 2003 bis 2005 war José Carlos Brandão Cabral zusätzlich Bischofsvikar. Ab 2005 war er zudem als Richter am interdiözesanen Kirchengericht der Kirchenprovinz Campinas tätig und ab 2008 als Kanzler der Kurie.[1]
Am 3. August 2022 ernannte ihn Papst Franziskus zum Bischof von São João da Boa Vista.[1] Die Amtseinführung erfolgte am 6. November desselben Jahres. Bereits ein gutes Jahr später, am 7. Dezember 2023, nahm Papst Franziskus seinen Rücktritt vom Amt des Bischofs von São João da Boa Vista an.[3]