Ab November 1900 nahm er dann am Zweiten Burenkrieg als Brevet-Major der Horse Guards teil.[2] In Südafrika stellte er ein Regiment namens The Scottish Horse auf. Am Ende des Krieges war daraus eine Brigade geworden und er selbst zu deren Colonel-Commandant.[3] 1902 wurde er als Member in den Royal Victorian Order aufgenommen.
Während der Friedenszeit bewarb er sich um einen Parlamentssitz im britischen House of Commons und wurde im Januar 1910 für die Unionisten im Wahlkreis West-Perthshire gewählt.[4] Im Januar 1917 verlor er sein Mandat, weil er durch den Tod seines Vaters dessen Adelstitel als 8. Duke of Atholl nebst nachgeordneten Titeln und den damit verbundenen Sitz im House of Lords erbte und dafür aus dem House of Commons ausschied.[5]
Er heiratete am 20. Juli 1899 in der St Margaret’s Church in London Katherine Marjorie Ramsay (1874–1960), Tochter des Sir James Ramsay, 10. Baronet (1832–1925). Seine Gattin wurde 1918 als Dame Commander des Order of the British Empire geadelt, war von 1924 bis 1929 parlamentarische Staatssekretärin des Bildungsministeriums und war schließlich von 1923 bis 1938 Abgeordnete der Labour Party im House of Commons für den Wahlkreis Kinross and West Perthshire.[6]
Da die Ehe kinderlos blieb, erbte, als er am 16. März 1942 starb, sein Bruder Lord James Stewart-Murray alle seine Titel.