Dubois studierte Theologie in Paris und erhielt am 28. September 1787 die Priesterweihe. 1791 floh er vor den Wirren der Französischen Revolution nach Amerika, wo er zunächst als Seelsorger tätig war. 1792 wurde er Pfarrer in Frederick, Maryland. Im Jahr 1800 wurde unter seiner Leitung mit dem Bau einer neuen Kirche begonnen. Er verließ seine Gemeinde 1806 und trat den Sulpizianern in Emmitsburg bei. Dort gründete er das St. Mary’s College, das später mit der Unterstützung der New Yorker Witwe und späteren Heiligen Elizabeth Bayley Seton das erste US-amerikanische religiöse Institut wurde, in dem Frauen Unterricht erhielten.
