Skytte war Privatlehrer des späteren Königs Gustav II. Adolf. Er wurde 1622 Kanzler der Universität Uppsala, wo er die Skytteanische Professur stiftete. Seit 1995 wird an der Universität Uppsala der nach ihm benannte Johan-Skytte-Preis für Politikwissenschaften vergeben.
Jenny Ingemarsdotter: Ramism, rhetoric and reform: An intellectual biography of Johan Skytte (1577–1645). Dissertation, Acta Universitatis Upsaliensis, Uppsala 2011. ISBN 978-91-554-8071-4 (PDF).
