18 Jahre, von 1972 bis 1990, war er Professor an der Akademie der bildenden Künste in München und wurde 1982 zum Mitglied der Bayerischen Akademie der Schönen Künste gewählt. Hermann Jünger war einer der international renommiertesten Vertreter seines Fachs. Er starb im Alter von 76 Jahren in seinem Wohnhaus in Pöring östlich von München.
Werke (Auswahl)
Altarkreuz und Vasa sacra für die St. Michaelis-Kirche in Diepholz, 1963