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Die Mannschaft wurde 1989 in Dänemark Vizeeuropameister. Zudem erreichte sie 1988 die Bronzemedaille und zweimal den 4. Platz (1985 und 1986). 1982 war sie beim europäischen Championat in der Zwischenrunde an der DFB-U-16 gescheitert und 1984 in der Gruppenphase – wieder mit Spielen gegen die Bundesrepublik (0:5, 0:1) – ausgeschieden.
In den 1980er-Jahren trainierten die Auswahl unter anderem Lothar Priebe (U-16-EM 1986), der spätere DFB-Nachwuchscoach Frank Engel (U-16-EM 1985 und 1988), der Ex-Nationalspieler Eberhard Vogel (U-16-EM und -WM 1989) und der frühere Oberligaspieler Horst Slaby (U-16-EM 1990).
Teilnahme an U-16-Weltmeisterschaften
Da die DDR-U16 angesichts uneindeutiger Auswahlkriterien (Ungarn wurde vom Weltverband eingeladen) bei der Premiere dieses FIFA-Wettbewerbs 1985 fehlte und als Vierter der U-16-EM 1987 bei nur drei europäischen Startplätzen auch das Turnier 1987 in Kanada knapp verpasste, war die ostdeutsche Jugendauswahl vor der Auflösung des Landes nur einmal bei der Weltmeisterschaft dabei.
Nach dem bei den beiden ersten Austragungen das Endrundenturnier vom DFV verpasst wurde, gehörte die ostdeutsche Auswahl von 1985 bis zum Ende der DDR 1990 zu den Stammgästen des kontinentalen Championats.