Fritz Fanta studierte von 1924 bis 1931 Architektur an der Deutschen Technischen Hochschule in Brünn, unter anderem bei seinem Vater Heinrich Fanta. Von 1930 bis 1938 war er Wissenschaftlicher Assistent in Brünn und wurde 1936 zum Dr.techn. promoviert. Er war parallel bei seinem Vater als Architekt tätig.
1938 wurde er Leiter Entwurfsamt im Stadtbauamt von Linz. 1943 wurde er Soldat und 1944 schwer verwundet mit Verlust des rechten Armes. 1945 nahm er seine Tätigkeit in Linz wieder auf. 1971 ging er in Ruhestand.
