Franz Winterer studierte Rechtswissenschaften. Nach Absolvierung des Studiums besuchte er das Konservatorium für Musik sowie die Offiziersschule. Franz Winterer war k.u.k. Offizier, in der Zwischenkriegszeit militärischer Berater des Republikanischen Schutzbundes, im Zweiten Weltkrieg Offizier der deutschen Luftwaffe, zuletzt Oberstleutnant. Auf Grund seiner militärischen Ausbildung – Winterer bekleidete den Rang eines Generalmajors – wurde er nach der Unabhängigkeitserklärung Österreichs 1945 in die provisorische Staatsregierung von Karl Renner berufen. Als Unterstaatssekretär war Winterer für das Heerwesen zuständig.
Nach den ersten Nationalratswahlen der zweiten Republik im Dezember 1945 wurde Franz Winterer Abgeordneter zum österreichischen Nationalrat. Nach Ende der Legislaturperiode 1949 verlor Winterer sein Mandat und schied aus dem Nationalrat aus.
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