Der Fluss entsteht bei der Siedlung Breedalbene, etwa 100 Kilometer südlich von Boulia an der Diamantina Developmental Road, aus dem Georgina River. Er fließt nach Süden, der Straße entlang, die er bei Bedourie unterquert. Dann folgt er der Eyre Developmental Road weiter nach Süden für weitere 50 Kilometer, um dann nach Westen abzubiegen. Der Eyre Creek durchfließt den Lake Koolivoo sowie den Lake Mipia und versickert dann östlich der Simpsonwüste im Untergrund.
Bei der Geisterstadt Annandale tritt er wieder an die Oberfläche und nimmt das Wasser des wenige Kilometer nördlich versickerten Mulligan River auf. Er setzt seinen Weg nach Süden am Rande der Simpsonwüste fort, überschreitet die Grenze nach South Australia und mündet in die Goyder Lagoon und damit in den Warburton River.[3]
Hay River – 75 m – Der Hay River versickert üblicherweise ca. 110 km nordwestlich des Eyre Creek in der Simpsonwüste. Nur in besonders nassen Jahren läuft er in den Eyre Creek über.