Das Stadion wurde am 3. September 1950 mit dem Spiel Racing Club Avellaneda gegen Vélez Sársfield (1:0) eröffnet.[1] Zu dieser Zeit fasste die Arena 100.000 Zuschauer. Ein Jahr später wurden die ersten Panamerikanischen Spiele 1951 vom argentinischen Präsidenten und Namensgeber Juan Perón sowie seiner Frau Eva Perón eröffnet.
1995 begann man mit der Überdachung des Stadions. Das transparente Dach überspannt die kompletten Zuschauerränge. Dazu wurde die Flutlichtanlage erneuert. Das Estadio Presidente Perón ist das erste vollüberdachte Stadion in Argentinien. Diese Arbeiten wurden 1997 abgeschlossen. Das Spielfeld ist mit 105 × 78 Meter eines der größten in Argentinien. 2002 bekam das Stadion innen wie außen eine Videoüberwachungsanlage. Durch einige Renovierungen sowie Sicherheitsauflagen des argentinischen Verbandes Asociación del Fútbol Argentino sank die Kapazität auf 64.161 Plätze. Als erstes Stadion in Argentinien wurde 2004 die Umzäunung vor den Tribünen entfernt.
Arsenal de Sarandí erreichte 2007 das Finale der Copa Sudamericana gegen Club América aus Mexiko. Das Rückspiel fand im größeren Estadio Presidente Perón statt, da Arsenals Stadion nur rund 16.000 Zuschauer fasst. Ein Jahr später zog Arsenal erneut zum Stadtnachbarn um, weil man das Finale der Recopa Sudamericana gegen Boca Juniors spielte. Heute ist die Spielstätte für 51.389 Zuschauer zugelassen.