Der Egelsee liegt in einer flachen, sumpfigen Senke, die aus einem würmeiszeitlichenToteiskessel hervorgegangen ist. In der unmittelbaren Umgebung erheben sich mehrere Moränenhügel. Westlich liegt der Ortsteil Hagenheim.
Der See ist stellenweise von Seerosen bedeckt und von einem Schilfgürtel umgeben. Am Nordufer befindet sich eine Fischerhütte.
Südlich des Egelsees befinden sich zwei weitere kleine Toteiskessel, wovon der südlichere als Geotop ausgewiesen ist.[1]