An der EHF Champions League 1999/2000 nahmen 34 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatligen für den Wettbewerb qualifiziert hatten. Es war die 40. Austragung der EHF Champions League bzw. des Europapokals der Landesmeister. Der Titelverteidiger war FC Barcelona. Die Pokalspiele begannen am 27. August 1999, das zweite Finalspiel fand am 29. April 2000 statt. Im Finale konnte sich wieder FC Barcelona durchsetzen, diesmal gegen THW Kiel.[1]
Zum Auftakt gab es zwei Begegnungen in einer Ausscheidungsrunde, gespielt im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel. Die Sieger qualifizierten sich für das Sechzehntelfinale, ebenfalls gespielt im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel. Die Sieger erreichten die Gruppenphase, die als „Champions League“ bezeichnet wurde. In der Gruppenphase mit vier Gruppen mit je vier Mannschaften, spielte in einer Gruppe jeder gegen jeden ein Hin- und Rückspiel. Die jeweils zwei Gruppenbesten erreichten das Viertelfinale. Ab dem Viertelfinale wurde wieder im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel gespielt. Der Gewinner des Finales war EHF Champions-League-Sieger der Saison 1999/2000.
Ausscheidungsrunde
Hin- und Rückspiel zwischen TJ VSŽ Košice und STIF Stranda fanden am 27./28. August 1999 in Skála statt.
Das Hinspiel der anderen Begegnung am 28. August in Nikosia und das Rückspiel am 4. September in Tiflis.
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
TJ VSŽ KošiceSlowakei
74:41
Faroer STIF Stranda
38:20
36:21
SPE Strovolou Nicosia Zypern 1960
34:53
Georgien 1990GTU Shevardeni Tbilisi
20:27
14:26
Sechzehntelfinals
Die Hin- und Rückspiele fanden zwischen dem 1. Oktober 1999 und 10. Oktober 1999 statt.
Die Hinspiele fanden am 19./20. März 2000 statt und die Rückspiele am 25./26./27. März 2000.
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
Hapoel Rishon LeZion Israel
48:50
DeutschlandTHW Kiel
26:24
22:26
Ademar León Spanien
50:54
SlowenienRK Celje
30:28
20:26
KC Veszprém Ungarn
53:55
KroatienBadel 1862 Zagreb
27:25
26:30
ZTR Saporischschja Ukraine
38:49
SpanienFC Barcelona
17:23
21:26
Halbfinals
Die Hinspiele fanden am 18./19. März 2000 statt und die Rückspiele am 25. März 2000.
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
THW KielDeutschland
45:43
Kroatien Badel 1862 Zagreb
32:21
13:22
FC BarcelonaSpanien
59:52
Slowenien RK Celje
39:25
20:27
Finale
Das Hinspiel in Kiel fand am 22. April 2000 statt und das Rückspiel in Barcelona am 29. April 2000.
Für FC Barcelona war es der fünfte Sieg bei der fünften aufeinanderfolgenden Finalteilnahme.