Von 1990 bis 1992 war er stellvertretender Direktor des Archäologieinstituts der Slowakischen Akademie der Wissenschaften in Nitra, 1992–2001 war er Mitglied des Präsidiums der Slowakischen Akademie der Wissenschaften (1995–2001 auch stellvertretender Vorsitzender der Slowakischen Akademie der Wissenschaften). 1992–1995 war er Mitglied des Rats der slowakischen Regierung für Wissenschaft und Technik. Seit 1994 hält er Vorlesungen an der Philosophischen Fakultät der Comenius-Universität Bratislava. Seit 2001 ist er stellvertretender Vorsitzender der politischen Partei SMER.
Wichtige Mitgliedschaften: Mitglied des Internationalen Slawistenausschusses in Warschau; Vertreter der Slowakischen Akademie der Wissenschaften beim International Social Science Council der UNESCO in Paris; Mitglied des Arbeitskreises für genetische Siedlungsforschung in Mitteleuropa in Bonn; Mitglied des Permanent Committee Rulalia v Tervuren in Belgien; Mitglied des Medieval Settlement Research Group v Durham im Vereinigten Königreich.
Čaplovič war stellvertretender Ministerpräsident der nach den Wahlen von 2006 gebildeten Fico-Regierung sowie der zuständige Minister für Europafragen, Menschenrechte und Minderheiten.[1][2] In der zweiten Fico-Regierung, die nach den Wahlen von März 2012 gebildet wurde, war er von April 2012 bis Juli 2014 Minister für Bildung, Jugend und Sport.[3][4]
Ausgewählte Werke
Osídlenie Ostrej skaly nad Vyšným Kubínom. In:AVANS v r. 1977, Nitra 1978
Orava v praveku, vo včasnej dobe dejinnej a na začiatku stredoveku, Martin 1987
The Situation of Archaeological Research of Middle Ages. Agricultural Settlements in the Territory of Slovakia, in: Ruralia I, 1996
Etnické zmeny a vývoj stredovekého osídlenia v juhovýchodných oblastiach karpatského oblúku (9.-12. storočie). In: Początki sąsiedztwa. Pogranicze etniczne polsko-rusko-słowackie w średniowieczu. Rzeszów 1996
Oblasti východných Karpát a horného Potisia za panovania Svätopluka I. In: Svätopluk I. 894-1994. Nitra 1997
Včasnostredoveké osídlenie Slovenska, Bratislava 1998
Osmičky v našich dejinách (Perfekt Brat. 1999)
Dokumenty slovenskej národnej identity a štátnosti I.,II. (Národné literárne centrum Brat. 1998)
Dejiny Slovenska. Mitautoren: Viliam Čičaj, Ľubomír Lipták, Ján Lukačka
