Ab Mitte der 1950er-Jahre wurde Taylor als Regisseur tätig, wonach er seine Schauspielkarriere zurückstellte. Er drehte in den 1950er- und 1960er-Jahren vor allem Episoden verschiedenster Fernsehserien. Sein erster Kinofilm Ente gut – Alles gut! mit Mickey Rooney in der Hauptrolle erschien im Jahr 1961, dem sollten zehn weitere Kinofilme unter seiner Regie folgen. Mit dem Film Flucht vom Planet der Affen drehte er 1971 die zweite Fortsetzung zu Planet der Affen. 1978 inszenierte er Damien – Omen II, die erste Fortsetzung des Horrorklassikers Das Omen. Er bekam den Job, da der ursprünglich vorgesehene Regisseur Mike Hodges auf Grund kreativer Differenzen die Produktion verlassen hatte. In den 1980er-Jahren klang seine Karriere als Regisseur mit der Inszenierung von Fernsehfilmen aus.
1964 war er für seine Regiearbeit für die Fernsehserie The Farmer's Daughter für einen Emmy Award nominiert. Für seine Arbeit an Die Insel des Dr. Moreau war Taylor 1978 für einen Saturn Award als Bester Regisseur nominiert.
Taylor war zweimal verheiratet. Mit der Schauspielerin Phyllis Avery war er von 1945 bis 1955 verheiratet, aus dieser Ehe stammen zwei Kinder. 1964 heiratete er die ebenfalls als Schauspielerin tätige Hazel Court, mit ihr hatte er einen Sohn und eine Tochter. Don Taylor ist auf dem Westwood Village Memorial Park Cemetery bestattet.
