Der César in der Kategorie Bester Animationsfilm(Meilleur film d’animation) wird seit 2011 verliehen. Die Mitglieder der Académie des Arts et Techniques du Cinéma vergeben ihre Auszeichnungen für die besten Filmproduktionen und Filmschaffenden rückwirkend für das vergangene Kinojahr.
Von 2011 bis 2013 traten auch kurze Animationsfilme in dieser Preiskategorie an, konnten sich in jenen drei Jahren jedoch nicht gegen die Langfilme durchsetzen. Seit 2014 haben sie wieder eine eigene Preiskategorie: Bester animierter Kurzfilm (Meilleur court métrage d’animation), welche es bereits in den Jahren 1977 bis 1990 gab.
Die unten aufgeführten Filme werden mit ihrem deutschen Verleihtitel (sofern vorhanden) angegeben, danach folgt in Klammern in kursiver Schrift der Originaltitel in der jeweiligen Landessprache und der Name des Regisseurs. Die Nennung des Originaltitels entfällt, wenn deutscher und Original-Filmtitel identisch sind. Die Gewinner stehen hervorgehoben an erster Stelle.
