Schérer trat in österreichische, dann in niederländische Kriegsdienste und wurde 1791, nach Frankreich zurückgekehrt, Capitaine in einem Linienregiment. 1793 machte er als Generaladjutant von General Alexandre de Beauharnais den Feldzug am Rhein mit, wurde 1794 zum Général de division befördert und erhielt den Oberbefehl über eine Division der Sambre- und Maasarmee.
Da er mehrere belgische Städte eroberte und einige Erfolge gegen die Österreicher erkämpfte, wurde Schérer 1795 mit dem Oberkommando der Armée des Alpes betraut. Bald darauf vertauschte er es mit dem der „Armée des Pyrénées“.
Am 3. Mai 1794 heiratete Schérer in Delle Françoise Henriette de Müller (1763–nach 1804) und hatte mit ihr drei Kinder, darunter Henriette (1795–1848), die später Claude-Juste-Alexandre Legrand (1762–1815) heiratete.
Nach dem Basler Frieden (1795) übernahm er an Kellermanns Stelle den Oberbefehl in Italien, gab ihn aber, da ihm seine Untätigkeit nach dem Sieg bei Loano (23. und 24. November) zum Vorwurf gemacht wurde, am 23. Februar1796 an Bonaparte ab.
Im Juli 1797 erhielt er vom Direktorium das Kriegsministerium, musste aber wegen seiner Unfähigkeit 1799 wieder davon zurücktreten und wurde an Jouberts Stelle erneut nach Italien geschickt.
Aber am 26. März bei Pastrengo, am 30. bei Verona und am 5. April bei Magnano von den Österreichern unter Kray geschlagen und hinter den Mincio und Oglio zurückgedrängt, trat er das Kommando an Moreau ab und zog sich auf sein Landgut Chauny (Aisne) zurück, wo er am 19. August 1804 starb. Sein schriftlicher Nachlass wird in den Archives nationales (Staatsarchiv) verwahrt.
Arnauld Divry: Les noms gravés sur l’arc de triomphe. L’Harmattan, Paris 2017, ISBN 978-2-917232-52-1.
Charles Mullié: Biographie des célébrités militaires des armées de terre et de mer de 1789 à 1855. Poignavant, Paris 1852 (2 Bände).
Georges Six: Dictionnaire biographique des généraux et amiraux français de la Révolution et de l’Empire 1792–1814. Saffroy, Paris 1999, ISBN 2-901541-06-2 (unveränderter Nachdruck Paris 1934)
Digby Smith: The Greenhill Napoleonic wars data book. Action and losses in personnel, colours, standars and artillery, 1792–1815. Greenhill Books, London 1998, ISBN 978-1-85367-276-7.
