Im Ersten präsentierte sie zwischen 2004 und 2007 das Magazin Tier Hoch Vier.[2] Von 2006 bis 2009 war sie auf VOX an der Seite von Bauleiter Sascha Slechta als Moderatorin der Handwerker-Sendung Wohnen nach Wunsch – Das Haus zu sehen. Am 9. August 2009 belegte sie als Kandidatin der Sendung Das perfekte Promi-Dinner den zweiten Platz. Von 2009 bis 2015 moderierte sie das Magazin Einsweiter auf dem Sender Einsfestival; von 2012 bis 2013 präsentierte sie dort auch die Musiksendung Clipster.[3] Seit 2013 erstellt Backhaus Beiträge für das WDR-Magazin west ART und übernimmt gelegentlich vertretungsweise die Moderation des Magazins sowie anderer kleinerer WDR-Sendungen. 2016 führte sie für den WDR durch die Mini-Sendereihe Unterwegs mit Anja Backhaus mit den Schwerpunkten „Auf Zeitreise im Ruhrgebiet“ und „Abenteuer Zeitreise im Rheinland“.[4]
Anja Backhaus ist seit 2006 Patin für den ökologischen Landbau.[6] Seit November 2011 ist sie eine der deutschen Botschafterinnen der UN-Dekade Biologische Vielfalt.[7]
