Skipanes betyder skibslandunge, formodentlig for det vikingerne allerede fra det 8. århundrede havde deres skibe opankret på stedet. Omkring år 1000 havde Tróndur í Gøtu sin vinterhavn her, men det er uvist, om stedet har været beboet.
Bygden blev grundlagt i 1841, da Jacob Niclassen bosætter sig.