Han skrev den 10. juni 2015 under på en toårig kontrakt, der løb frem til 30. juni 2017.[4] Han spillede for U/19-holdet i U/19 Divisionen 2017-18 herefter.[4] Han forlængede i december 2016 sin kontrakt frem til sommeren 2018.[5][6]
Marcus Bobjerg debuterede for AC Horsens den 18. august 2017 i 6. spillerunde af Superligaen 2017-18, da han startede inde, da Jesse Joronen kort før kampstart konkluderede, at han ikke kunne spille.[7][8] Han havde i de foregående fem runder siddet på bænken som reserve.[7] Han holdt målet rent, idet kampen mod AaB endte 0-0, og fansene kårede ham da som kampens spiller.[7]
Han vesklede i løbet af sæsonen mellem at være tredjekeeper efter Joronen og Frederik Nørgaard[9] og reservekeeper efter Joronen.[7] Joronen var dog knæskadet i starten af april 2018, hvorfor han stod kampen mod Brøndby IF i 28. spillerunde, som AC Horsens tabte 5-1 ude.[10] Målet til 2-0 kritiserede han sig selv for.[10] Han spillede ikke kampene i runde 29 og 30,[11] men igen i runde 32 den 21. april stod han på mål i en kamp mod FC København, som AC Horsens tabte 4-1 ude.[12] Han spillede ligeledes de resterende fem slutspilskampe.[11]
Skive IK
Det blev den 29. maj 2018 offentliggjort, at 2. divisionsklubben Skive IK havde hentet Bojerg på en etårig aftale.[13][9]
