Han er især kendt for en række vandtårne, hvoraf dog det væsentligste (i Maribo) er revet ned. Det var formentlig det første vandtårn af jernbeton i Danmark. Hans vandtårn i Nysted blev fredet2003. Han byggede en række villaer i nationalromantisk stil, som blev rost for fantasifuld udførelse og fint håndværk. Hans huse i Søborg er påvirket af K.T. Seest og Bedre Byggeskik. Derudover huskes Alf Jørgensen primært for sine fornemme arkitekturhistoriske opmålinger, hvor opmålingen af Reformert Kirke i København er den bedst kendte.
Han ægtede 2. november 1912 i Odense Anna Augusta Basse (født 11. maj 1885 i København -), datter af xylograf Herman Ludvig Basse og Margrethe Thomasdatter.