Cafodd ei eni yn Llanfechain yn 1833. Bu Thomas yn gadeirydd Cymdeithas Hynafiaethol Cymru ac yn olygydd Archaeologica Cambrensis. Ei gampwaith yw ei 'History of the Diocese of S. Asaph'.
Addysgwyd ef yng Ngholeg yr Iesu, Rhydychen. Yn ystod ei yrfa bu'n aelod o Gymdeithas Hynafiaethau Llundain.