V roce 1880 se stal vedoucím nemocnice v bulharskémLom Palanka. V květnu roku 1882 opustil Bulharsko a začal cestovat. Nakonec se usadil v Praze. Napsal zde předmluvu k prvnímu číslu měsíčníku Aušra. V Praze potkal také svoji budoucí ženu, Sudetskou Němku Gabrielu Eleonoru Mohlovou. Vzali se v květnu 1884 a ihned po svatbě se přestěhovali do Bulharska.
Památníky a ulice
V letech 1883–1884 žil Basanavičius v Praze. Toto období jeho života připomíná pamětní deska na domě čp. 529 v Balbínově ulici v pražských Vinohradech.[1]