Karel Cyprián z Thun-Hohensteinu, Jiří Vigil z Thun-Hohensteinu a Kryštof Antonín Šimon z Thun-Hohensteinu (sourozenci) František Alfons Xaver z Thun-Hohensteinu (vnuk)
V roce 1647 se oženil s Annou Barborou hraběnkou z Thun-Caldes (1632–1709), dcerou Jan Arbogasta z Thun-Caldes a jeho manželky Judity z Arco. Anna Barbora je popisována jako cnostná a na svou dobu velmi vzdělaná žena. Byla patronkou chudých a vynikající hudebnicí, mistrně ovládala hru na citeru a spinet a udržovala korespondenci s italskými a německými panovníky.
Hrabě Alfons František z Thun-Hohensteinu a Castell-Brughier zemřel 24. srpna1688 v Padově. Anna Barbora přežila svého manžela o 21 let, zemřela v prosinci roku 1709.