L'any 1916 adoptà el nom Maó Foot-ball Club.[2] Aquells anys aparegueren nous clubs com el Seislan Foot-ball Club, fundat el 1917,[3] i el Menorca Foot-ball Club, fundat el 1918. El 1921, el Maó FC s'independitzà de l'Ateneu, esdevenint Maonès Foot-ball Club.[2][3] El 17 de novembre de 1922, els clubs Maonès FC i Seislan FC es fusionaren esdevenint Unió Sportiva Maó.[3] El nou club fou campió de Menorca el 1924. El 1926 fou campió balear, títol que repetí el 1927 i el 1928, aquest darrer fou el primer campionat oficial balear. Aquest triomf el portà a participar per primer cop en el campionat d'Espanya de 1928, essent el primer club balear en participar en aquesta competició. La temporada 1950-51 ascendí per primer cop a Tercera Divisió. La temporada 1954-55 es proclamà per primer cop campió de tercera i disputà la fase d'ascens a segona.
L'any 1974, la UE Maó es fusionà amb el Club Esportiu Menorca creant el Club de Futbol Sporting Maonès.[5] El club continuà competint en futbol base, i en categoria absoluta es creà la Unión Deportiva Seislán, jugant amb samarreta blanca i pantaló negre. Després d'una llarga batalla legal, l'any 2001 el club fou autoritzat a competir amb el nom i símbols de l'antic club.[5]