Establert a Bruges cap al 1540, el 1543 va ser admès al gremi de pintors de la ciutat, el Gremi de Sant Lluc;[1] gairebé al mateix temps es va casar amb la germana del pintor local Lancelot Blondeel.[2] Va romandre a Bruges fins a la seva mort el 1584.
Va destacar en els gèneres del retrat, inclòs el retrat de grup, les escenes al·legòriques i la pintura religiosa, com el monumental oli "El Judici Final" de 228,5 x 181 cm que es troba al Groeningemuseum de Bruges. La seva producció abasta 40 pintures signades o documentades i d'altres 30 atribuïdes. També va realitzar dissenys arquitectònics amb motiu de la celebració de l'entrada a Bruges del príncep Felip II de Castella el 1549.
El Museu del Prado en guarda un tríptic dedicat als sants Joans, amb el Baptisme de Crist a la taula central, la degollació del Baptista i Sant Joan Evangelista a Patmos a les taules laterals i els sants Pere i Pau en grisalla a les cares exteriors.[3] Altres obres relacionades amb el taller de Pourbus es conserven al Museu de Belles arts de Sevilla (Baptisme de Crist) i al Museu Lázaro Galdiano (Retrat d'un monjo amb breviari).[4][5]
