Va guanyar-se un lloc a la màxima categoria del món del motor després de guanyar el Campionat Formula Open Nissan de l'any 1998 aconseguint així una prova per al modest equip de F1 Minardi. En aquesta prova els responsables de l'equip Italia van quedar impressionats i, posteriorment, gràcies al suport de Telefònica, va aconseguir seient oficial per aquest equip.
L'any 1999 va debutar a la Fórmula 1, aconseguint un punt al Gran Premi d'Europa després d'aconseguir la sisena posició. Posteriorment va ser nomenat "Millor debutant de l'any 1999".
Posteriorment, l'any 2001 va passar a formar part de l'escuderia Williams com a pílot provador on va romandre fins a l'any 2004. Durant aquest període va disputar una cursa substituint al lesionat Ralf Schumacher aconseguint una meritòria cinquena posició. L'any 2004 va substituir de nou per dues ocasions a Ralf Schumacher.
A finals del 2004 va fitxar com a pilot provador de Ferrari on ha continuat des de la temporada 2006 fins a l'actualitat.
És de los pocs pilots de Fórmula 1 que a més és llicenciat, concretament en economia, i parla fins a 5 idiomes.
Gené va acabar segon als 1.000 Quilòmetres de Nürburgring del 2007, fent parella amb Nicolas Minassian.